“整理” は「セイリする」の語形で使われる動作性名詞です。
いっぽう “生理” は “生理食塩水” や “生理現象” など 形容詞的に用いられる名詞です。女性の月経に関する遠回しな言い方でもあります。英語で physiology (フィジオロジー) や physiological と言い換えられなくもないですが、長くて正しいカナ表記が定めにくく、あまり便利とは言えません。
“整理” は “片付け” など言い換える表現は あるものの 処分する意味合いが含まれるなど完全に一致させるのは難しく、手頃に対応できるのは整理整頓とか 書類整理とか どうしても何か付け足すことになりがちで、文字を増やさずは難しい語です。
“生理” と “整理” では ともに理の字を共通に持つため、ともに音読みのままで区別しようとすると生と整の字の音の衝突を解かねばなりません。ここで整は敕の下に正を置く会意形声字で音を同じくするため、正と生の衝突に帰結します。
いずれも日本語では「セイ」「ショウ」の両方の読みがあり、“公正” “校正” “更正” “厚生” “更生” “抗生”、“生死” “正史”、“生体” “正対” など多量の衝突、また星 性 征 政など共通の部を持つ字もそれぞれ多くあります。
変更は極めて困難ではありますが、新しい音を当てることは 変換ミスや聞き違いを防ぐには かなり有益でしょう。
中国の読みでは、生には普通話で「ション (sheng1)」であり、また近い字で産には「サン」もあるなど、後ろの字には「ン」が適している可能性があります。
対して正のほうは zheng4 で これは「ツォン」「チョン」「チォン」などに あたります。広東語をあたると「チェン(zing)」に近くなります。チョンは「丁髷(ちょんまげ)」の字があるものの、他はどれも日本語に無いので 副作用はあまり考えなくて良いです。
またそれらの子音だけ借りて日本語の「セイ」音に近くすると、他に「ツェイ」「チェイ」なども考えられます。「チェイ」は 英語由来の「チェイン(chain)」「チェイサー(chaser)」などカタカナ語に現れることから、すでに聞き分けは十分可能でしょう。
どちらのケースもですが、「ショウ」には旧仮名遣いで「セウ」の書き方があります。廃した仮名遣いとは言え、「セイ」と「ショウ」から１字ずつとった分かりやすさがあります。正に対して ツァ行・チャ行を当てるなら、対比として生には「セウ」は 有効です。漢字変換IMEに “整理”が誤って現れないように “生理”=“セウリ” で登録しておくと 新型の入力であることを示すことができます。